Top 10 software de facturación para pymes: comparativa 2025
Por Josevi Digital
Comparativa actualizada de los mejores programas de facturación para pymes y autónomos: precios, funcionalidades, integraciones y casos de uso específicos para cada tipo de negocio.
Escrito por Josevi Digital
Top 10 software de facturación para pymes: comparativa 2025 (con precios reales)
Elegir mal el software de facturación cuesta tiempo y dinero. Cambiar después de seis meses implica migrar datos, reconfigurar integraciones y formar de nuevo al equipo. Esta comparativa analiza las 10 opciones más relevantes para pymes españolas en 2025, con precios actualizados y casos de uso específicos.
Cómo usar esta comparativa
Identifica primero tu perfil: autónomo con facturación ocasional, micropyme con volumen medio, o pyme que necesita integración con ERP y CRM. Después revisa las opciones recomendadas para tu caso. Los precios son orientativos y pueden variar según promociones o volumen contratado.
1. FacturaDirecta
Perfil ideal: Autónomos y micropymes que buscan solución online sencilla sin instalación.
Web oficial: facturadirecta.com
FacturaDirecta es una plataforma web de facturación que permite crear, enviar y gestionar facturas desde cualquier navegador. No requiere instalación ni mantenimiento técnico. Incluye plantillas personalizables, envío automático por email, y gestión básica de clientes y productos.
Ventajas:
- Interfaz intuitiva con curva de aprendizaje mínima
- Acceso desde cualquier dispositivo con conexión
- Actualizaciones automáticas sin intervención del usuario
- Soporte técnico en español
Limitaciones:
- Funcionalidades avanzadas limitadas (sin módulos de inventario o proyectos)
- Integraciones con terceros más reducidas que alternativas
- Dependencia de conexión a internet para operar
Precio: Plan Gratis disponible. Consultar precios de planes en la web oficial. Prueba gratuita de 30 días.
Caso de uso: Consultor freelance que factura 10-20 clientes mensuales y necesita solución rápida sin complicaciones técnicas.
2. B2BRouter
Perfil ideal: Empresas que facturan principalmente a otras empresas (B2B) y necesitan cumplimiento estricto de facturación electrónica.
Web oficial: b2brouter.net
B2BRouter se especializa en facturación electrónica B2B con integración directa a sistemas de clientes corporativos. Gestiona el ciclo completo: emisión, envío, recepción de confirmación, y trazabilidad. Cumple todas las normativas de facturación electrónica obligatoria y VeriFactu.
Ventajas:
- Especialización en B2B con conectores para grandes clientes
- Cumplimiento normativo garantizado (facturación electrónica, VeriFactu)
- Gestión de estados de factura (enviada, recibida, aceptada, rechazada)
- Integración con ERPs empresariales
Limitaciones:
- Sobrecualificado para negocios B2C o con facturación simple
- Curva de aprendizaje más pronunciada
- Precio superior a soluciones básicas
Precio: Consultar precios según volumen. Consultar para planes empresariales.
Caso de uso: Proveedor industrial que factura a empresas medianas y grandes que exigen facturación electrónica estructurada.
3. Factusol
Perfil ideal: Autónomos y micropymes con presupuesto ajustado que necesitan solución básica certificada.
Web oficial: sdelsol.com/factusol
Factusol es un software gratuito de Software DELSOL. Cubre facturación básica, gestión de clientes y productos, y cumple con los requisitos legales de facturación. Requiere instalación en Windows y conocimientos mínimos de configuración.
Ventajas:
- Completamente gratuito
- Compatible con normativa española de facturación
- Cumplimiento normativo garantizado
- Actualizaciones regulares del proveedor
Limitaciones:
- Interfaz anticuada y poco intuitiva
- Sin integraciones con otras herramientas (CRM, contabilidad, pagos)
- Requiere instalación local (no cloud)
- Funcionalidades limitadas a lo básico
Precio: Gratuito.
Caso de uso: Autónomo que empieza y necesita facturar correctamente sin inversión inicial en software.
4. Holded
Perfil ideal: Pymes que buscan solución todo-en-uno: facturación, contabilidad, CRM y gestión de proyectos.
Web oficial: holded.com
Holded integra facturación con contabilidad, CRM, gestión de proyectos, inventario y tesorería. Permite automatizar flujos completos: desde presupuesto hasta cobro y conciliación bancaria. Interfaz moderna y actualizaciones frecuentes.
Ventajas:
- Plataforma completa que elimina necesidad de múltiples herramientas
- Automatizaciones avanzadas (recordatorios, facturación recurrente)
- Integraciones con bancos, pasarelas de pago, y herramientas externas
- App móvil funcional
Limitaciones:
- Puede resultar complejo si solo necesitas facturación básica
- Precio superior a soluciones especializadas solo en facturación
- Curva de aprendizaje inicial para aprovechar todas las funcionalidades
Precio: Consultar precios por plan en la web oficial. Prueba gratuita de 14 días; promociones frecuentes (p. ej., 3 meses al 50%).
Caso de uso: Agencia de marketing con 5-10 empleados que necesita gestionar proyectos, facturar clientes, y llevar contabilidad integrada.
5. Quipu
Perfil ideal: Autónomos y pequeñas empresas que priorizan simplicidad y relación calidad-precio.
Web oficial: getquipu.com
Quipu se centra en autónomos y micropymes. Facturación, gestión de gastos, y contabilidad simplificada en una interfaz limpia. Incluye escaneo de tickets con OCR, conciliación bancaria automática, y preparación de impuestos trimestrales.
Ventajas:
- Diseñado específicamente para autónomos españoles
- Precio muy competitivo para las funcionalidades que ofrece
- Escaneo de gastos con OCR (fotografía ticket y extrae datos)
- Preparación automática de modelos fiscales (303, 130, etc.)
Limitaciones:
- Menos adecuado para empresas con equipos grandes
- Funcionalidades de inventario y proyectos limitadas
- Integraciones con terceros más reducidas que Holded
Precio: Desde 8,5€/mes (Starter), 15€/mes (Solution) y 29,5€/mes (Premium). 50% de descuento los primeros 3 meses. Prueba gratuita de 15 días.
Caso de uso: Diseñador freelance que necesita facturar, controlar gastos, y preparar impuestos sin complicaciones.
6. A3 Software
Perfil ideal: Pymes medianas que necesitan solución robusta con soporte local y cumplimiento normativo garantizado.
Web oficial: wolterskluwer.com/a3factura
A3 es un ERP español especializado en pymes. Módulos de facturación, contabilidad, nóminas, y gestión comercial. Fuerte presencia en España con red de partners para soporte e implementación. Cumplimiento estricto de normativa española.
Ventajas:
- Especialización en mercado español y normativa local
- Red de partners para soporte presencial si es necesario
- Módulos escalables según crecimiento de la empresa
- Integración profunda entre facturación, contabilidad y nóminas
Limitaciones:
- Precio superior a soluciones cloud más ligeras
- Interfaz menos moderna que alternativas recientes
- Requiere inversión inicial en configuración e implantación
Precio: a3facturago: 9,95€/mes. a3facturapro: desde 39€/mes. 1 mes gratis y 2 meses gratis con contratación anual.
Caso de uso: Empresa de servicios con 15-30 empleados que necesita gestión integral y soporte local garantizado.
7. Zoho Books
Perfil ideal: Empresas que operan internacionalmente o necesitan integraciones con ecosistema Zoho.
Web oficial: zoho.com/books
Zoho Books es parte del ecosistema Zoho (CRM, email, proyectos, etc.). Facturación multidivisa, gestión de inventario, portal de clientes, y automatizaciones avanzadas. Fuerte en integraciones y API abierta para desarrollos personalizados.
Ventajas:
- Integración nativa con todo el ecosistema Zoho
- Facturación multidivisa y multi-idioma
- API robusta para integraciones personalizadas
- Relación calidad-precio competitiva
Limitaciones:
- Interfaz puede resultar sobrecargada con tantas opciones
- Soporte en español mejorable comparado con soluciones locales
- Adaptación a normativa española menos específica que A3 o Holded
Precio: Consultar precios en la web oficial. Prueba gratuita de 14 días.
Caso de uso: Empresa de software que factura clientes en España, Latinoamérica y Europa, y usa Zoho CRM.
8. SumUp Facturas
Perfil ideal: Negocios físicos (tiendas, restaurantes) que necesitan facturación integrada con TPV.
Web oficial: sumup.com/es-es/facturas
SumUp combina TPV físico con facturación online. Ideal para negocios que cobran presencialmente con tarjeta y necesitan emitir facturas. Sincronización automática entre ventas en TPV y facturas emitidas.
Ventajas:
- Integración perfecta entre TPV físico y facturación
- Configuración rápida sin conocimientos técnicos
- App móvil para facturar desde cualquier lugar
- Sin permanencia ni costes ocultos
Limitaciones:
- Funcionalidades contables limitadas (no sustituye a contabilidad completa)
- Menos adecuado para empresas puramente digitales sin TPV
- Integraciones con terceros más limitadas
Precio: Plan Gratis (hasta 4 facturas/mes). Plus: 8€/mes (plan anual). TPV físico desde 19€ (pago único). Sin permanencia.
Caso de uso: Tienda de ropa que cobra con TPV y necesita emitir facturas a clientes que las solicitan.
9. Anfix
Perfil ideal: Pymes que trabajan con gestoría y necesitan colaboración en tiempo real.
Web oficial: anfix.com
Anfix es una plataforma cloud colaborativa. Permite que empresa y gestoría trabajen sobre los mismos datos en tiempo real. Facturación, contabilidad, y gestión fiscal compartida. Fuerte en automatización de procesos contables.
Ventajas:
- Colaboración en tiempo real con gestoría (accesos diferenciados)
- Automatización de procesos contables (conciliación, asientos)
- Actualizaciones normativas automáticas
- Interfaz moderna y usable
Limitaciones:
- Requiere que la gestoría también use Anfix para máximo aprovechamiento
- Funcionalidades de CRM y proyectos limitadas
- Precio puede ser elevado para autónomos simples
Precio: Desde 4,99€/mes (pago anual, Básico) o 5,99€/mes (mensual). Planes superiores entre 12,49€ y 99,99€/mes según funcionalidades. Prueba gratuita de 15 días.
Caso de uso: Empresa de servicios que trabaja con gestoría externa y quiere eliminar el envío de documentos por email.
10. Billin
Perfil ideal: Autónomos y pequeñas empresas que valoran diseño y experiencia de usuario.
Web oficial: billin.net
Billin destaca por su interfaz visual y facilidad de uso. Facturación, presupuestos, albaranes, y gestión de gastos con diseño cuidado. Incluye plantillas de factura personalizables y portal de cliente para que vean su histórico.
Ventajas:
- Interfaz más cuidada y moderna del mercado
- Curva de aprendizaje mínima (todo es intuitivo)
- Plantillas de factura profesionales y personalizables
- Portal de cliente para consulta de facturas y pagos
Limitaciones:
- Funcionalidades avanzadas (inventario, proyectos) limitadas
- Integraciones con terceros en desarrollo
- Menos adecuado para empresas con procesos complejos
Precio: Básico: 6,6€/mes. Pro: 12,5€/mes. Ilimitado: 20€/mes (facturación anual, +IVA). Ilimitado Plus: consultar. Prueba gratuita de 30 días.
Caso de uso: Fotógrafo freelance que valora la imagen profesional de sus facturas y necesita herramienta simple.
Tabla comparativa rápida
| Software | Precio desde | Ideal para | Facturación electrónica | Integraciones | Curva aprendizaje |
|---|---|---|---|---|---|
| FacturaDirecta | Gratis / Consultar | Autónomos | ✓ | Básicas | Baja |
| B2BRouter | Consultar | B2B empresarial | ✓✓✓ | ERPs | Media-Alta |
| Factusol | Gratis | Presupuesto cero | ✓ | Ninguna | Media |
| Holded | Consultar | Pymes completas | ✓ | Muchas | Media |
| Quipu | 8,5€/mes | Autónomos | ✓ | Medias | Baja |
| A3 Software | 9,95€/mes | Pymes medianas | ✓✓ | ERP completo | Alta |
| Zoho Books | Consultar | Internacional | ✓ | Ecosistema Zoho | Media |
| SumUp Facturas | Gratis / 8€/mes | Negocio físico + TPV | ✓ | TPV SumUp | Baja |
| Anfix | 4,99€/mes | Con gestoría | ✓ | Contables | Media |
| Billin | 6,6€/mes | Diseño y UX | ✓ | En desarrollo | Muy baja |
Matriz de decisión según tu perfil
Autónomo que empieza (0-20 facturas/mes):
- Presupuesto cero: Factusol
- Presupuesto ajustado: Quipu o Billin
- Valoras diseño: Billin
Micropyme (20-100 facturas/mes):
- Necesitas todo-en-uno: Holded
- Trabajas con gestoría: Anfix
- Negocio físico con TPV: SumUp Facturas
Pyme mediana (100+ facturas/mes):
- Facturación B2B compleja: B2BRouter
- Necesitas ERP completo: A3 Software
- Operación internacional: Zoho Books
Empresa de servicios digitales:
- Gestión de proyectos integrada: Holded
- Colaboración con gestoría: Anfix
- Facturación simple: FacturaDirecta
Errores comunes al elegir software de facturación
Error 1: Elegir solo por precio El software más barato puede salir caro si no cubre tus necesidades. Cambiar después implica migración de datos, reconfiguración, y formación del equipo. Evalúa el coste total considerando tiempo ahorrado y funcionalidades necesarias.
Error 2: No considerar el crecimiento Elige software que escale contigo. Si prevés crecer, mejor una solución con módulos adicionales que cambiar de plataforma en un año. Holded, A3 y Zoho Books ofrecen escalabilidad clara.
Error 3: Ignorar las integraciones Si usas CRM, contabilidad externa, o pasarelas de pago, verifica que el software se integre. Duplicar datos manualmente entre sistemas genera errores y consume tiempo. Holded y Zoho Books destacan en integraciones.
Error 4: No probar antes de contratar Todos ofrecen periodo de prueba gratuito. Úsalo. Emite 5-10 facturas reales, prueba el envío a clientes, y verifica que el flujo funcione para tu caso específico.
Error 5: Olvidar el cumplimiento normativo Verifica que el software cumpla con facturación electrónica obligatoria y VeriFactu. B2BRouter, A3 y Holded garantizan cumplimiento. Factusol, al ser de Hacienda, también.
Checklist de evaluación (10 preguntas antes de decidir)
- ¿Cumple con facturación electrónica obligatoria y VeriFactu?
- ¿Se integra con mi contabilidad/CRM/banco actual?
- ¿Puedo personalizar plantillas de factura con mi imagen corporativa?
- ¿Permite facturación recurrente si la necesito?
- ¿Incluye recordatorios automáticos de pago?
- ¿Tiene app móvil funcional si facturo fuera de la oficina?
- ¿El soporte técnico es en español y en horario compatible?
- ¿Puedo exportar todos mis datos si cambio de software?
- ¿Los costes están claros o hay cargos ocultos por usuarios/facturas extra?
- ¿La curva de aprendizaje es asumible para mi equipo?
Consideraciones finales
La mejor opción depende de tu caso específico. Factusol funciona para empezar sin inversión. Quipu y Billin son excelentes para autónomos que valoran simplicidad. Holded destaca si necesitas solución completa. A3 y B2BRouter son opciones sólidas para empresas con requisitos avanzados.
Aprovecha los periodos de prueba gratuitos. Prueba 2-3 opciones en paralelo con facturas reales antes de decidir. El tiempo invertido en elegir bien se recupera en meses de operación eficiente.
¿Necesitas ayuda para implementar facturación electrónica o integrar tu software con otros sistemas? Escríbenos desde la página de contacto y te asesoramos sin compromiso.
Preguntas frecuentes
¿Puedo cambiar de software después si no me convence? Sí, pero implica migrar datos históricos, reconfigurar integraciones, y formar al equipo. Por eso es crítico elegir bien desde el principio. Todos los software mencionados permiten exportar datos.
¿El software gratuito (Factusol) es suficiente? Para facturación básica sí. Si necesitas integraciones, automatizaciones, o gestión avanzada, las opciones de pago ofrecen mucho más valor por el coste mensual.
¿Qué pasa con mis datos si cancelo la suscripción? Verifica la política de cada proveedor. La mayoría permite exportar facturas en PDF y datos en CSV/Excel. Algunos (como Holded) ofrecen acceso de solo lectura tras cancelar.
¿Necesito certificado digital para facturación electrónica? Sí, para firmar facturas electrónicas según la normativa. Todos los software mencionados (excepto Factusol que lo gestiona diferente) requieren certificado digital de empresa.
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Sobre el autor
Josevi Digital
Gestión empresarial, facturación, ERPs y presencia web
Consultor especializado en digitalización operativa para pymes. Experto en facturación electrónica, ERPs, CRM, webs corporativas y herramientas de gestión que facilitan el día a día empresarial.
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