Top 10 software de facturación para pymes: comparativa 2026

Elegir software de facturación en 2026 ya no va solo de hacer facturas bonitas. Para una pyme española también importa que el programa esté preparado para la Ley Antifraude, VeriFactu, la factura electrónica B2B, la colaboración con la gestoría y las integraciones con bancos, CRM, ecommerce o ERP.

Esta comparativa está revisada en mayo de 2026. Los precios son orientativos, normalmente sin IVA, y pueden cambiar por promociones, facturación anual o módulos adicionales. Antes de contratar, confirma siempre el precio final y pide al proveedor la declaración responsable o documentación de cumplimiento que aplique a tu caso.

Lo importante antes de comparar

Hay dos obligaciones que se suelen mezclar, pero no son exactamente lo mismo:

• VeriFactu / Ley Antifraude: afecta a los sistemas informáticos de facturación. El calendario vigente del Reglamento de Sistemas Informáticos de Facturación fija la adaptación antes del 1 de enero de 2027 para contribuyentes del Impuesto sobre Sociedades y antes del 1 de julio de 2027 para el resto de obligados, con excepciones como empresas acogidas al SII o territorios con normativa propia.
• Factura electrónica B2B: el Real Decreto 238/2026 desarrolla la obligación entre empresarios y profesionales. Su aplicación efectiva se cuenta desde la orden ministerial de la solución pública: 12 meses para empresas con más de 8 millones de euros de volumen de operaciones y 24 meses para el resto.

Traducción práctica: no elijas una herramienta solo porque diga “factura electrónica”. Pregunta si cubre VeriFactu, Facturae/FACe cuando lo necesites, comunicación B2B, estados de factura, exportación de datos y conexión con tu asesoría.

Tabla comparativa rápida

Software	Precio desde	Mejor para	Punto fuerte	Cuidado con
FacturaDirecta	Gratis / 10-12 €/mes	Autónomos y micropymes	Facturación cloud sencilla	Plan gratis limitado
Holded	15 €/mes habitual	Pymes que quieren todo en uno	Facturación, contabilidad, CRM, bancos y proyectos	Puede ser demasiado si solo haces facturas simples
Quipu	14-17 €/mes	Autónomos y servicios	Gastos, impuestos, banco y gestoría	Menos orientado a equipos grandes
Billin	6,6-8 €/mes	Autónomos que priorizan facilidad	UX, VeriFactu, Facturae y plantillas	Límites por clientes/productos en planes bajos
Anfix	4,99-5,99 €/mes	Pyme con gestoría	Fiscalidad, contabilidad y colaboración	El plan básico limita facturas anuales
B2Brouter	Gratis / 110 €/año	B2B y factura electrónica estructurada	Envío/recepción e integración con redes	No es la opción más simple para facturación básica
a3factura	9,95 €/mes	Pymes con asesoría o entorno Wolters Kluwer	Soporte local, asesor y gestión comercial	Más “gestión” que herramienta ligera
Sage Active / Sage 50	12,50 €/mes promo / 45 €/mes	Pymes que quieren contabilidad y ERP escalable	Marca consolidada, módulos e IA	Coste superior en Sage 50
TeamSystem Factusol	Desde 20 €/mes	Comercio, stock y gestión más completa	Local o nube, stock, SII, TicketBAI	Más técnico que una app cloud simple
Zoho Books	Gratis / 15 $/mes	Empresas internacionales o ecosistema Zoho	Multidivisa, API y conexión con Zoho CRM	Revisa adaptación española con conectores

1. FacturaDirecta

Perfil ideal: autónomos y micropymes que quieren facturar online sin instalar nada y sin montar un ERP.

Web oficial: facturadirecta.com

FacturaDirecta es una solución cloud centrada en facturas, presupuestos, gastos y contabilidad básica. Su punto fuerte es que puedes empezar rápido, con una curva de aprendizaje razonable y sin depender de una instalación local.

Ventajas:

• Plan gratis para probar con volumen muy bajo.
• Planes claros: Gratis, Básico, Avanzado y Total.
• El proveedor indica que incluye VeriFactu incluso en el plan gratuito.
• Buena opción para quien quiere simplicidad antes que un sistema completo.

Limitaciones:

• El plan gratis tiene límites de clientes y productos.
• Si necesitas stock avanzado, proyectos o CRM, puede quedarse corto.
• Para una pyme con varios departamentos quizá convenga mirar Holded, Sage, a3factura o Factusol.

Precio orientativo: plan Gratis. Plan Básico: 12 €/mes o 10 €/mes con pago anual. Plan Avanzado: 24 €/mes o 20 €/mes anual. Plan Total: 48 €/mes o 40 €/mes anual.

Cuándo elegirlo: si haces facturas recurrentes o sencillas, quieres evitar Excel y no necesitas una implantación pesada.

2. Holded

Perfil ideal: pymes que buscan una plataforma todo en uno para facturación, contabilidad, tesorería, proyectos, CRM e inventario.

Web oficial: holded.com/pricing

Holded encaja bien cuando la factura no es un documento aislado, sino parte de un flujo más grande: presupuesto, proyecto, gastos, conciliación bancaria, cobro, contabilidad y reporting.

Ventajas:

• Muy completo para empresas de servicios, agencias, ecommerce y equipos en crecimiento.
• VeriFactu incluido en planes actuales.
• Conexión bancaria, facturas recurrentes, remesas, inventario y módulos adicionales.
• Acceso para asesor contable incluido en los planes.

Limitaciones:

• Puede resultar excesivo para un autónomo que solo emite pocas facturas al mes.
• Algunas funciones avanzadas viven en planes superiores o add-ons.
• Requiere dedicar tiempo a configurar bien contactos, bancos, impuestos y flujos.

Precio orientativo: para autónomos, el plan Plus figura desde 15 €/mes antes de promociones. Para pequeñas empresas, Basic desde 29 €/mes, Standard desde 59 €/mes y Advanced desde 99 €/mes, con descuentos temporales frecuentes.

Cuándo elegirlo: si quieres reducir herramientas sueltas y centralizar gestión, cobros, proyectos y contabilidad.

3. Quipu

Perfil ideal: autónomos y pequeñas empresas de servicios que quieren facturación, gastos, previsión fiscal y conciliación bancaria sin complicarse.

Web oficial: getquipu.com

Quipu está muy orientado al día a día del autónomo: emitir facturas, controlar gastos, escanear tickets, preparar impuestos y colaborar con gestoría. Es menos “ERP” y más herramienta operativa.

Ventajas:

• Enfoque claro en autónomos y pequeños negocios españoles.
• Planes con facturas y presupuestos ilimitados.
• Adaptado a VeriFactu según su página de precios.
• OCR, banco, API e integraciones en planes superiores.

Limitaciones:

• El plan Starter puede quedarse corto si necesitas banco, albaranes o API.
• No es la mejor opción si necesitas inventario complejo, producción o permisos por equipo.
• Conviene confirmar con tu gestoría si trabaja cómodamente con Quipu.

Precio orientativo: Starter desde 17 €/mes mensual o 14 €/mes con pago anual. Solution desde 30 €/mes mensual o 25 €/mes anual. Premium desde 59 €/mes mensual o 49 €/mes anual. Suele haber promociones iniciales.

Cuándo elegirlo: si tu prioridad es tener facturas, gastos e impuestos bajo control con una herramienta ligera.

4. Billin

Perfil ideal: autónomos, freelancers y pequeñas empresas que valoran una interfaz muy sencilla y facturas profesionales.

Web oficial: billin.net/precios

Billin, ahora dentro del entorno TeamSystem, compite muy bien en facilidad de uso. Es una buena opción para quienes quieren pasar de plantillas o Excel a una herramienta moderna sin entrar en un ERP.

Ventajas:

• Planes económicos y fáciles de entender.
• VeriFactu, Facturae y TicketBAI incluidos según la página de precios.
• App móvil, plantillas, recurrentes, remesas y conexión con gestor.
• Integración con Shopify y API en beta, útil si vendes online.

Limitaciones:

• El plan Básico limita clientes, usuarios, productos y escaneos.
• Si tienes stock avanzado o procesos de compras complejos, mira Factusol, Sage o a3factura.
• Algunas integraciones todavía dependen del plan o están en evolución.

Precio orientativo: Básico 6,6 €/mes con pago anual o 8 €/mes mensual. Pro 12,5 €/mes anual o 15 €/mes mensual. Ilimitado 20 €/mes anual o 24 €/mes mensual.

Cuándo elegirlo: si quieres algo muy usable, con buen aspecto visual y suficiente para facturación diaria.

5. Anfix

Perfil ideal: autónomos y pymes que trabajan de cerca con gestoría y quieren combinar facturación, contabilidad, impuestos y banco.

Web oficial: anfix.com/precios

Anfix es interesante cuando el valor no está solo en emitir facturas, sino en tener la parte contable y fiscal más conectada. Su enfoque encaja especialmente bien si la gestoría participa en el flujo.

Ventajas:

• Todos los planes incluyen facturación, tesorería, contabilidad, impuestos, bancos y conciliación.
• VeriFactu aparece incluido en la comparativa de planes.
• Buen encaje con asesorías y despachos.
• Planes escalables según volumen de facturas.

Limitaciones:

• El plan Básico es barato, pero limitado a 60 facturas emitidas al año.
• Si solo quieres hacer facturas rápidas, puede sentirse más contable de lo necesario.
• Los módulos de stock y proyectos son adicionales.

Precio orientativo: Básico desde 4,99 €/mes con pago anual o 5,99 €/mes mensual. Avanzado desde 12,49 €/mes anual. Profesional desde 24,99 €/mes anual. Planes superiores para más volumen.

Cuándo elegirlo: si tu gestoría trabaja con Anfix o quieres que facturación, impuestos y contabilidad estén en el mismo sitio.

6. B2Brouter

Perfil ideal: empresas B2B que emiten o reciben factura electrónica estructurada y necesitan conexión con clientes, administraciones, redes o ERPs.

Web oficial: b2brouter.net/precios

B2Brouter no es la típica herramienta “bonita” para hacer cuatro facturas. Su valor está en la factura electrónica B2B, el envío y recepción de documentos, la trazabilidad y la integración con otros sistemas.

Ventajas:

• Plan gratuito para empezar con límites.
• Especialización en factura electrónica, VeriFactu, Facturae, Peppol y conexiones B2B.
• Muy útil si tus clientes grandes exigen formatos concretos.
• Puede integrarse con ERP o actuar como capa de intercambio.

Limitaciones:

• Menos cómodo que Billin, FacturaDirecta o Quipu si solo necesitas facturación básica.
• La curva de aprendizaje es mayor.
• El precio real depende del volumen y del tipo de producto contratado.

Precio orientativo: plan Basic gratis hasta límites de contactos y transacciones. Professional desde 110 €/año + IVA. Business y productos integrados dependen de necesidades.

Cuándo elegirlo: si tu problema principal no es “hacer facturas”, sino enviarlas, recibirlas y trazarlas correctamente en entornos B2B.

7. a3factura

Perfil ideal: pymes que quieren una solución española, con soporte, asesor conectado y recorrido hacia una gestión más completa.

Web oficial: wolterskluwer.com/a3factura

a3factura, de Wolters Kluwer, tiene mucho sentido cuando la empresa ya trabaja con asesorías o soluciones A3. Es más conservadora que herramientas puramente SaaS, pero fuerte en soporte, cumplimiento y colaboración profesional.

Ventajas:

• a3facturago para necesidades simples y a3facturapro para gestión más completa.
• Datos y facturas ilimitados en los planes.
• Integración con soluciones contables de Wolters Kluwer.
• Invitación al asesor y soporte online.

Limitaciones:

• Menos ligera que herramientas pensadas solo para autónomos.
• El multiusuario en a3facturapro tiene coste adicional por usuario.
• Para ecommerce o CRM avanzado, quizá necesites integraciones adicionales.

Precio orientativo: a3facturago desde 9,95 €/mes. a3facturapro desde 39 €/mes. Usuario adicional en Pro: 6 €/mes.

Cuándo elegirlo: si tu asesoría usa A3 o necesitas una solución de facturación con un proveedor muy asentado en España.

8. Sage Active / Sage 50

Perfil ideal: pymes que quieren facturación y contabilidad con una marca consolidada, soporte empresarial y posibilidad de crecer hacia gestión más avanzada.

Web oficial: sage.com/es-es

Sage tiene dos caminos interesantes para pymes: Sage Active, más cloud y sencillo, y Sage 50, más completo para gestión comercial, contabilidad, stock y escenarios con varios usuarios.

Ventajas:

• Sage Active cubre facturación y contabilidad online para pequeñas empresas.
• Sage 50 añade gestión comercial, stock, punto de venta y módulos avanzados.
• Buen encaje para empresas que vienen de ContaPlus o FacturaPlus.
• Sage 50 comunica cumplimiento con Ley Antifraude y factura electrónica.

Limitaciones:

• Sage 50 tiene un coste de entrada mayor que alternativas ligeras.
• Puede requerir asesoramiento para elegir edición, local/nube y módulos.
• Si solo emites pocas facturas, probablemente sea demasiado.

Precio orientativo: Sage Active Starter aparece promocionado desde 12,50 €/mes + IVA y Essentials desde 24,50 €/mes + IVA. Sage 50 Essential desde 45 €/mes + IVA con contrato anual.

Cuándo elegirlo: si la facturación ya forma parte de una gestión empresarial más amplia y quieres una solución con recorrido.

9. TeamSystem Factusol

Perfil ideal: comercios, pymes con stock, empresas con gestión de compras/ventas y negocios que prefieren trabajar en local o nube.

Web oficial: teamsystem.es/factusol

Factusol ha evolucionado desde el conocido entorno Software DELSOL hacia TeamSystem Factusol. Ya no conviene presentarlo como “software gratuito de Hacienda”: no es de Hacienda y su propuesta actual va más por gestión completa, soporte y cumplimiento.

Ventajas:

• Gestión de presupuestos, pedidos, albaranes, facturas, compras, cobros y stock.
• Opción de trabajar con datos en local o en la nube.
• El proveedor indica adaptación a Ley Antifraude, VeriFactu, TicketBAI/Batuz, SII y factura electrónica.
• Buen encaje para negocios con almacén, artículos, tarifas o TPV.

Limitaciones:

• Más técnico que una solución cloud simple.
• Puede requerir configuración inicial y formación.
• El precio puede depender del plan, soporte y modalidad contratada.

Precio orientativo: TeamSystem comunica planes desde 20 €/mes para Factusol en su página de VeriFactu. Conviene pedir presupuesto si necesitas soporte, nube, multiusuario o integraciones.

Cuándo elegirlo: si necesitas más gestión comercial y stock que una simple app de facturas.

10. Zoho Books

Perfil ideal: empresas con clientes internacionales, multidivisa o ecosistema Zoho ya implantado.

Web oficial: zoho.com/books

Zoho Books es fuerte en automatización, multidivisa, API y conexión con Zoho CRM. Para empresas españolas, el matiz importante es revisar cómo cubrirás la normativa local: puede tener sentido con integraciones como B2Brouter o desarrollos específicos.

Ventajas:

• Plan gratuito para microempresas dentro de ciertos límites de ingresos.
• Buenas integraciones con Zoho CRM, proyectos, inventario y automatizaciones.
• API sólida para conectar con procesos propios.
• Muy útil si facturas fuera de España o trabajas con varias divisas.

Limitaciones:

• La adaptación a normativa española no es tan directa como en herramientas locales.
• Los precios principales se muestran en dólares en la página global.
• Necesitarás validar bien VeriFactu, Facturae y factura electrónica B2B antes de usarlo como sistema principal en España.

Precio orientativo: plan Free disponible con límites de ingresos. Standard desde 15 $/mes, Professional desde 40 $/mes y planes superiores según funciones.

Cuándo elegirlo: si ya usas Zoho CRM o tienes operativa internacional, pero valida antes la capa fiscal española.

¿Y SumUp Facturas?

SumUp Facturas puede ser útil para negocios físicos que ya usan SumUp y necesitan emitir facturas sencillas: tiene plan gratis hasta 4 facturas al mes y plan Plus desde 8 €/mes. Aun así, para una pyme española en 2026 no lo pondría como sistema principal sin confirmar expresamente su hoja de ruta de VeriFactu, factura electrónica B2B y exportación fiscal con tu gestoría.

Matriz de decisión según tu perfil

Autónomo con pocas facturas al mes:

• Presupuesto mínimo: FacturaDirecta, Billin o Anfix Básico si encaja el límite anual.
• Más control de gastos e impuestos: Quipu.
• Factura visual y uso sencillo: Billin.

Micropyme de servicios:

• Gestión todo en uno: Holded.
• Gestoría muy presente: Anfix o a3factura.
• Proyectos, gastos y bancos: Holded o Quipu Solution.

Comercio, stock o TPV:

• Stock y gestión comercial: Factusol o Sage 50.
• Ecosistema Sage: Sage 50.
• TPV muy sencillo ligado a cobros: SumUp como complemento, no necesariamente como sistema fiscal principal.

Empresa B2B con clientes exigentes:

• Factura electrónica estructurada: B2Brouter.
• ERP con capa de e-factura: B2Brouter integrado.
• Gestión interna más facturación: Sage, a3factura, Holded o Factusol.

Empresa internacional:

• Multidivisa y Zoho CRM: Zoho Books con validación fiscal española.
• Operativa española y contabilidad local fuerte: Sage o Holded.
• Factura electrónica transfronteriza: B2Brouter.

Errores comunes al elegir software de facturación

Error 1: Confundir PDF con factura electrónica

Un PDF enviado por email puede ser válido en muchos casos actuales, pero no equivale necesariamente a factura electrónica estructurada B2B. Si tus clientes van a exigir formato estructurado, estados o conexión con plataformas, necesitas algo más que “descargar PDF”.

Error 2: Elegir solo por precio

Una herramienta barata sale cara si luego no exporta bien, no conecta con tu gestoría, no soporta rectificativas correctamente o se queda corta con tus bancos, stock o ecommerce.

Error 3: No preguntar por la declaración responsable

Con VeriFactu y la Ley Antifraude, no basta con un sello comercial. Pide documentación del sistema informático de facturación, declaración responsable, funcionamiento de registros, QR, trazabilidad y política de conservación.

Error 4: Ignorar a la gestoría

Si tu asesor trabaja con A3, Anfix, Sage o un flujo concreto, elegir una herramienta aislada puede generar trabajo manual cada trimestre. La mejor herramienta es la que encaja con tu proceso real.

Error 5: No probar el flujo completo

Antes de pagar un año, crea clientes, presupuestos, facturas, rectificativas, gastos, cobros, exportaciones y acceso para asesor. Cinco facturas reales de prueba dicen más que veinte comparativas.

Checklist antes de contratar

1. ¿El proveedor indica adaptación a VeriFactu y puede facilitar documentación?
2. ¿Permite factura rectificativa, anulaciones y series correctamente?
3. ¿Soporta Facturae/FACe si facturo a administraciones?
4. ¿Está preparado para factura electrónica B2B o se integra con una plataforma que lo esté?
5. ¿Exporta todos mis datos en formatos usables si cambio de software?
6. ¿Se conecta con mi banco y mi gestoría?
7. ¿Permite usuarios, permisos y acceso de asesor sin pagar de más?
8. ¿Gestiona cobros, vencimientos y recordatorios?
9. ¿Cubre stock, albaranes, proyectos o ecommerce si los necesito?
10. ¿El soporte está en español y responde en horarios útiles para mi negocio?

Recomendación final

Si eres autónomo y quieres simplicidad, empieza comparando FacturaDirecta, Quipu y Billin. Si trabajas muy pegado a gestoría, mira Anfix o a3factura. Si necesitas una plataforma completa para empresa, compara Holded, Sage y Factusol. Si tu dolor es la factura electrónica B2B, B2Brouter debe estar en la conversación.

La decisión no debería salir de una tabla de precios, sino de tu flujo real: cómo vendes, cómo cobras, quién lleva la contabilidad, qué sistemas usas ya y qué obligaciones fiscales te afectan.

¿Necesitas ayuda para elegir software, migrar datos o integrar facturación con CRM, ecommerce o banco? Escríbenos desde la página de contacto y revisamos tu caso.

Preguntas frecuentes

¿VeriFactu ya es obligatorio en 2026?

La obligación de adaptar los sistemas informáticos de facturación está fijada para 2027: antes del 1 de enero para contribuyentes del Impuesto sobre Sociedades y antes del 1 de julio para el resto, salvo excepciones. En 2026 conviene prepararse, pedir documentación al proveedor y evitar contratar herramientas sin hoja de ruta clara.

¿La factura electrónica B2B ya tiene fecha definitiva?

El Real Decreto 238/2026 está publicado, pero la aplicación efectiva se cuenta desde la orden ministerial que desarrolla la solución pública. Desde esa orden: 12 meses para empresas con más de 8 millones de euros de volumen de operaciones y 24 meses para el resto.

¿Puedo seguir usando Excel o Word para facturar?

Para salir del paso puede haber casos simples, pero no es una buena estrategia para 2027. Un sistema de facturación adaptado debe garantizar integridad, trazabilidad, conservación y generación de registros de facturación. Excel no está pensado para eso.

¿Necesito certificado digital?

En muchos flujos sí, especialmente para trámites con la AEAT, FACe, firma o remisión de información. La necesidad concreta depende del software y del tipo de factura, así que conviene validarlo con el proveedor y la gestoría.

¿Cuál es el mejor software de facturación para una pyme?

No hay uno universal. Para servicios y gestión completa, Holded suele encajar bien. Para asesoría y fiscalidad, Anfix o a3factura. Para stock y comercio, Factusol o Sage 50. Para factura electrónica B2B, B2Brouter.

Fuentes consultadas

• Real Decreto 1007/2023, Reglamento de sistemas informáticos de facturación
• Real Decreto 238/2026, factura electrónica obligatoria B2B
• Precios de FacturaDirecta
• Precios de Holded
• Precios de Quipu
• Precios de Billin
• Precios de Anfix
• Precios de B2Brouter
• Precios de a3factura
• Soluciones y precios de Sage España
• TeamSystem Factusol
• Precios de Zoho Books

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